結合自由エネルギー計算
MP-CAFEE (Massively Parallel Computation of Absolute binding Free Energy with well-Equilibrated states) | |
開発責任者 | 藤谷 秀章(東京大学 先端科学技術研究センター 特任教授) |
標的タンパク質と低分子量有機化合物の結合親和性(結合自由エネルギー)を大規模分子動力学シミュレーションによって精密に計算する |
FUJI force field | |
開発責任者 | 藤谷 秀章(東京大学 先端科学技術研究センター 特任教授) |
高精度タンパク質力場 |
GENESIS | |
開発責任者 | 杉田有治(理化学研究所開拓研究本部 杉田理論分子研究室 主任研究員) |
タンパク質、膜、核酸、糖鎖など、生体内分子系のための分子動力学ソフトウェア |
Free Energy Perturbation (FEP) | |
開発責任者 | 杉田有治(理化学研究所開拓研究本部 杉田理論分子研究室 主任研究員) |
標的タンパク質とリガンドの結合親和性を精密に計算する |
その他の計算手法を見る場合は、下記のフロー図より選択してください。