TSMD(Tree Search Molecular Dynamics Simulation)
・APOマルチコンフォーメーション生成、タンパク質間ネットワーク推定開発責任者
津田 宏治(東京大学大学院 新領域創成科学研究科 教授)主な開発者
寺山 慧 (理化学研究所 革新知能統合研究センター)内容
タンパク質のフォールディングの過程を、高速にシミュレーションすることができる。どんなことができるか
創薬のターゲットを絞り込む際に、タンパク質のフォールディングの過程を知ることで、重要な知見を得ることができる。関係論文
【参考文献】[1] K. Shin, D. P. Tran, K. Takemura, A. Kitao, K. Terayama, and K. Tsuda, "Enhancing biomolecular sampling with reinforcement learning: tree search molecular dynamics simulation method," ACS Omega, 2019.