CafeMol
・APOマルチコンフォーメーション生成、タンパク質間ネットワーク推定開発責任者
高田 彰二 (京都大学 大学院理学研究科 教授)主な開発者
検崎博生 (理化学研究所)Cheng Tan
Diego Ugarte (京都大学 大学院理学研究科)
寺川剛 (京都大学 大学院理学研究科 助教)
Wenfei Li
内容
生体分子の粗視化分子動力学シミュレーションどんなことができるか
タンパク質、核酸、脂質など生体分子、およびその複合体の分子シミュレーションにより、その動態を見ることができる。関係論文
【参考文献】Hiroo Kenzaki, Nobuyasu Koga, Naoto Hori, Ryo Kanada, Wenfei Li, Kei-ichi Okazaki, Xin-Qiu Yao, and Shoji Takada , CafeMol: A coarse-grained biomolecular simulator for simulating proteins at work, Journal of Chemical Theory and Computation , 7: 1979-1989, 2011
